编号10:WSSV病毒microRNA对对虾细胞自噬的影响研究

发稿时间:2019-05-06浏览次数:1004

成果名称:WSSV病毒microRNA对对虾细胞自噬的影响研究

研发人员:吴文林   

所属领域:生物医学

完成单位:泉州师范学院

项目简介

1  建立了对虾自噬研究模型。

2 获得了对虾自噬诱导后基因表达变化的数据库。采用对虾转录组测序分析,提取对照组和自噬诱导组对虾的RNA,分析自噬诱导条件下对虾基因转录变化。结果发现了3050个基因的表达出现变化,其中自噬诱导条件下1456个基因表达上调,1594个基因表达下调。通过差异表达基因的聚类分析、GO功能富集、KEGG注释、KEGG通路富集分析等手段,分析这些差异表达基因与细胞代谢、环境应激等过程的关系,为找到对虾自噬相关基因及其cDNA序列奠定了良好基础。

3 获得了WSSV感染后对虾miRNA的表达谱并发现和鉴定了新的miRNA分子。对WSSV感染对虾和健康对虾的miRNA测序结果进行分析,共预测出59 miRNA,其中已知miRNA 5 个,新预测miRNA 54 个。对这59microRNA的表达谱的分析发现,当对虾被WSSV感染后,有8miRNA的表达上调。

4 获得了52个来源于WSSVmiRNA分子及其序列。对这52miRNA的功能开展研究,分析其与细胞自噬作用的关系,有利于揭示WSSV感染对细胞自噬的影响,促进我们对WSSV病毒感染机制的了解。


Baidu
map